Unité mixte de recherche 1256 NGERE
Nutrition-génétique et exposition aux risques environnementaux
Bâtiment C, Campus Brabois-Santé
9 Avenue de la Forêt de Haye, BP 20199
54505 VANDOEUVRE-LES-NANCY
David MEYRE
david.meyre [at] univ-lorraine.fr
Caroline REPPERT
caroline.reppert [at] univ-lorraine.fr
Chiffres clés de l'unité
- 63 Enseignants-chercheurs
- 3 Chercheurs statutaires
- 37 Habilitations à Diriger des Recherches (HDR)
- 22 Personnels d'appui à la recherche
- 21 / 8 Doctorants /
Post-doctorants - 437 Publications ACL
2018-2023
Thématiques de recherche / Savoirs faire
Approche intégrative et ciblée dans les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI)
Notre objectif est d'étudier la physiopathologie des MICI à travers une approche translationnelle visant à caractériser l’impact de l’exposome dans les mécanismes moléculaires et cellulaires à l’origine de ces pathologies. L’équipe développe également des projets d’innovations thérapeutiques et de monitoring non invasif au travers de nombreuses collaborations locales, nationales et internationales. Ces travaux s’inscrivent au cœur du programme scientifique de l’IHU INFINY en matière de recherche fondamentale et translationnelle.
Contact(s) :
Laurent PEYRIN-BIROULETlaurent.peyrin-biroulet [at] univ-lorraine.frDjesia ARNONEdjesia.arnone [at] univ-lorraine.frBiomarqueurs multiomiques et prédictifs dans les pathologies tumorales
Notre objectif est d'étudier les mécanismes biologiques sous-jacents à la génèse, l’évolution et les mécanismes de résistance tumorale pour identifier de nouvelles cibles thérapeutiques dans les lymphomes B indolents et transformés, les tumeurs du système nerveux central, les cancers broncho-pulmonaires et les cancers de la fente olfactive. Nous développons des approches intégratives en omiques multiples et des outils bioinformatiques dédiés à la génomique des cancers.
Contact(s) :
Julien BROSÉUSjulien.broseus [at] univ-lorraine.frGuillaume GAUCHOTTEguillaume.gauchotte [at] univ-lorraine.frMétabolisme des monocarbones et épigénomique des origines développementales des maladies héréditaires et complexes
La carence précoce en micronutriments donneurs de méthyle crée des mécanismes de programmation fœtale sur les maladies rares et complexes. Cela résulte de mécanismes complexes dans lesquels les interactions entre la génétique, l’épigénomique et les facteurs métaboliques et nutritionnels du métabolisme des monocarbones (1-CM) jouent un rôle prédominant. L’équipe dissèque ces interactions pour étudier la pathogenèse de l’obésité pathologique, des maladies neuro-développementales (groupe 1), des maladies rares du métabolisme (groupe 2) et des maladies complexes liées à la programmation fœtale (groupe 3).
Contact(s) :
Rosa-Maria RODRIGUEZ-GUEANTrosa-maria.gueant-rodriguez [at] univ-lorraine.frCarine BOSSENMEYER-POURIEcarine.pourie [at] univ-lorraine.frDavid COELHOdavid.coelho [at] inserm.frEnvironnement, biologie intégrative et médecine de précision de l'obésité et de ses comorbidités
L'obésité et ses comorbidités résultent de l'interaction entre des facteurs environnementaux (mauvaise alimentation, sédentarité, stress, pollution) et biologiques (sexe, âge, changements hormonaux (par exemple, puberté, grossesse, ménopause, andropause), le microbiote intestinal, la programmation fœtale, l'épigénétique et la génétique). Notre objectif principal est d'élucider les déterminants de l'obésité et de ses comorbidités et d'accélérer le passage de la médecine conventionnelle à la médecine de précision de l'obésité en France et dans le monde. Le projet examinera 4 sous-ensembles d'obésité : l'obésité environnementale, l'obésité développementale, l'obésité monogénique et l'obésité polygénique.
Contact(s) :
David MEYREdavid.meyre [at] univ-lorraine.fr
Personnel
Caroline REPPERT Référente administrative UL
Laurent PEYRIN-BIROULET Directeur adjoint
David COELHO Directeur adjoint
David MEYRE Directeur UL, CHRU
Doctorants
- 6A these 2023MARION DIVOUXApproche génomique des syndromes myélodysplasiques et myéloprolifératifs/myélodysplasiquesGenomic approach of myelodysplastic syndromes and myeloproliferative/myelodysplastic syndromesDirecteur de thèse :Pierre FEUGIERCo-directeur de thèse :Julien BROSEUS
- 4A these 2024Irina ROTARUSpécificités cellulaires métaboliques de l'invalidation du gène de la méthionine synthaseCellular metabolic specifics of methionine synthase gene invalidationDirecteur de thèse :Rosa-Maria GUEANT-RODRIGUEZ
- 4A these 2024PAUL HENRI GRAINDORGERôles des hydrocarbures aromatiques polycycliques en tant que facteurs aggravants des conséquences cérébrales induits par la stéatose hépatique non alcooliqueRoles of polycyclic aromatic hydrocarbons as aggravating factors of brain consequences induced by nonalcoholic fatty liver diseaseDirecteur de thèse :Nathalie GROVACo-directeur de thèse :Henri SCHROEDER
- 4A these 2023VINCENT HAGHNEJAD BURCHERIContribution de TREM-1 aux maladies stéatosiques du foieContribution of TREM-1 to fatty liver diseasesDirecteur de thèse :Jean-Pierre BRONOWICKICo-directeur de thèse :Jean-Louis GUEANT
- 4A these 2022JEAN-MARIE RAVELApport des outils bio-informatiques dans l'analyse de pathologies humaines par l'analyse de réseaux moléculaires et dans l'amélioration des pratiques en génétique médicaleContribution of bioinformatics tools in the analysis of human pathologies through molecular network analysis and in the improvement of medical genetic practicesDirecteur de thèse :Inna KUPERSTEINCo-directeur de thèse :Céline BONNET
- 3A these 2024Sandra EL KOUCHEAssociation entre l'exposition à diverses classes de polluants perturbateurs endocriniens, le stress, et les variations de poids chez le jeune adulte.Association between endocrine disruptors, stress, and weight variations in young adults.Directeur de thèse :David MEYRE
- 3A these 2024CLAIRE NOMINEFacteurs prédictifs de reprise pondérale après chirurgie bariatriquePredictive factors for weight regain after bariatric surgeryDirecteur de thèse :David MEYRE
- 3A these 2024ELISE POURIÉConséquence d'une altération du métabolisme des monocarbones dans la physiopathologie de Huntington.Consequences of the perturbation on the one-carbon metabolism in the pathophysiology of Huntington's disease.Directeur de thèse :Mathilde RENAUD
- 3A these 2024NICOLAS SCHEYERInteractions entre métabolisme des monocarbones et axe corticotrope : approche expérimentale et clinique (étude MONOCORT)Interactions between the metabolism of monocarbon compounds and Hypothalamic-pituitary-adrenal axis : an experimental and clinical approach (the MONOCORT study)Directeur de thèse :Brigitte LEININGER-MULLERCo-directeur de thèse :Rosa-Maria GUEANT-RODRIGUEZ
- 3A these 2023SALOME PUISIEUXÉtude de la N-Homocystéinilation de la Huntingtine dans la Maladie de Huntington.Monocarbon metabolism disorders in Huntington's disease.Directeur de thèse :Carine BOSSENMEYER-POURIECo-directeur de thèse :Mathilde RENAUD
- 3A these 2023MANON JEANDELInteractome de la méthionine synthase et compartimentation de la synthèse de méthionineInteractome of methionine synthase and compartmentalization of methionine synthesisDirecteur de thèse :David COELHOCo-directeur de thèse :Jean-Louis GUEANT
- 3A these 2023ARNAUD MICHELImpact d'une CArence périnatale en DOnneurs de Méthyle sur le dialogue Intestin-CErveau en période post-natale (CADOMICE).Impact of perinatal MEthyl Donor Deficiency in BRAIn-Gut communication during postnatal stage (MEDDBRAIG).Directeur de thèse :Grégory POURIECo-directeur de thèse :Tunay KOKTEN
- 3A these 2023AUDREY MALARDEEtude de l'efficacité et de la toxicité d'un transporteur synthétique de cuivre (TSC) dans le traitement d'un modèle murin de la maladie de Menkès.Study of efficacy and toxicity (cellular models) of a new copper transporter and in the treatment of a mouse model of Menkes diseaseDirecteur de thèse :François FEILLETCo-directeur de thèse :Jean-Marc ALBERTO
- 2A these 2024Noémie CAMMICIOTTOEtude de l'état de cataplérose dans les aciduries organiques et dans le choc septique et de sa prise en charge par l'acide carglumique et diverses molécules anaplérotiques sur modèles cellulaires et modèles murins.Study of the state of cataplerosis in organic aciduria and in septic shock and its management by carglumic acid and various anaplerotic molecules on cell models and mouse models.Directeur de thèse :François FEILLETCo-directeur de thèse :Arnaud WIEDEMANN
- 2A these 2024Maud FERTIGEffet synergique de la carence gestationnelle en folate et l'exposition aux toxiques environnementaux sur le développement cérébral : évaluation de l'effet protecteur de la vitamine D.Synergistic effects of folate gestational deficiency and exposure to environmental pollutants on brain development: evaluation of the protective effect of Vitamin DDirecteur de thèse :Brigitte LEININGER-MULLERCo-directeur de thèse :Ramia SAFAR-ALSAIED
- 2A these 2024Ghislain FIEVETIntelligence artificielle explicable pour la fiabilité des algorithmes d'apprentissage automatique, l'analyse et la découverte dans les données omiques.Explainable artificial intelligence for the reliability of machine learning algorithms, analysis and discovery in omics data.Directeur de thèse :Julien BROSEUSCo-directeur de thèse :Sébastien HERGALANT
- 2A these 2024GUILLEMETTE CLEMENTEtude de la N-homocystéinylation des protéines clés dans la maladie d'Alzheimer (HO-MA)Study of N-homocysteinylation of Tau and MAP1 in Alzheimer's diseaseDirecteur de thèse :Carine BOSSENMEYER-POURIECo-directeur de thèse :Mathilde RENAUD
- 2A these 2023Romain PIUCCOCaractérisation épigénétique et protéomique du syndrome de RichterEpigenetic and proteomic characterization of Richter syndromeDirecteur de thèse :Julien BROSEUS
- 1A these 2024ZEINAB ALSAKLYEtude de l'efficacité et de la sécurité de nanoclusters de fer pour pallier lescarences martiales sur modèles cellulaires et murinsStudy of the effectiveness and safety of iron nanoclusters to compensate for iron deficiencies in cellular and mouse modelsDirecteur de thèse :David COELHOCo-directeur de thèse :François FEILLET
- 1A these 2024SOUMEN KONARCD Dynamique nutritionnelle, signatures épigénétiques et microbiote intestinal : Anatomie d'un carrefour de la programmation fœtale de l'obésité pédiatriqueCD Unveiling the Crossroads: Nutritional Dynamics, Epigenetic Signatures, and Gut Microbiota in Fetal Programming of Pediatric ObesityDirecteur de thèse :Jean-Louis GUEANTCo-directeur de thèse :Thomas SauterCo-tutelle :University of Luxembourg
LUXEMBOURG - 1A these 2024MARGAUX DA COSTACD Modulation de la réponse gliale dans la Maladie d'Alzheimer via la régulation d'ApoECD Gliosis Modulation in Azheimer disease through ApoE regulationDirecteur de thèse :Thomas CLAUDEPIERRECo-directeur de thèse :Sandra KAMINSKI
- 1A these 2024WAEL ABDEL KARIMCartographie fine de l'association entre les polymorphismes codants non-synonymes du gène NPC1 et l'obésité adulte identifiée par étude d'association pangénomique dans la population européenneFine mapping of the association between non-synonymous coding polymorphisms of the NPC1 gene and adult obesity identified by genome-wide association study in the European populationDirecteur de thèse :David MEYRECo-directeur de thèse :Natacha DREUMONT
- 1A these 2024CELIE NIGONNeuroinflammation Induite par une Exposition Précoce à l'α-Héxabromocyclododécane chez le rat : Impact sur la Connectivité Neuronale dans l'émergence des Troubles du Spectre AutistiqueNeuroinflammation induced by early exposure to α-HexaBromoCycloDoDecane in rats: impact on neuronal connectivity in the emergence of autism spectrum disordersDirecteur de thèse :Henri SCHROEDERCo-directeur de thèse :Chloé MOREL
- 1A these 2024MELISSA CURAKUImpact des facteurs environnementaux sur les changements épigénétiques des patients atteints de maladies inflammatoires chroniques de l'intestin.Impact of environmental factors on epigenetic changes in patients with inflammatory bowel diseases.Directeur de thèse :Laurent PEYRIN-BIROULETCo-directeur de thèse :MARIE BOUDAUD
- 1A these 2024CLAIRE MASIImpact des Microplastiques alimentaires dans la sévérité de l'inflammationintestinaleImpact of Food Microplastics on the Severity of InflammationintestinalDirecteur de thèse :Natacha DREUMONTCo-directeur de thèse :Djésia ARNONE
- 1A these 2022Jordi ROMADéveloppement d'un cadre de modélisation multi-échelles par contraintes intégrant le métabolisme, la régulation épigénétique et le microbiomeDevelopment of a multi-scale constraint-based modeling framework integrating metabolism, epigenetic regulation, and the microbiomeDirecteur de thèse :Jean-Louis GUEANTCo-directeur de thèse :Almut HEINKEN
Pas de soutenance pour le moment
- ADRIENNE ASTRID GALLIZZIImplication des neutrophiles dans les reactions d'hypersensibilité immédiate aux bétalactamesInvolvement of neutrophils in immediate hypersensitivity reactions to betalactamesDirecteur de thèse :Jean-Louis GUEANTCo-directeur de thèse :Almut HEINKEN
- Sébastien HERGALANTGénomique des maladies rares et complexes/communes du métabolisme et de ses comorbiditésGenomics of rare and complex/common metabolic diseases and their comorbiditiesDirecteur de thèse :David MEYRE
- JEAN-MARIE RAVELApport des outils bio-informatiques à l'étude de pathologies humaines par l'analyse de réseaux moléculaires et à l'amélioration des pratiques en génétique médicale.The contribution of bioinformatics tools to the study of human pathologies through the analysis of molecular networks and the improvement of medical genetics practices.Directeur de thèse :Inna KUPERSTEINCo-directeur de thèse :Céline BONNET
- PAULINE DIMOFSKICarence en donneurs de méthyles d’origine paternelle : impact sur le développement cérébral et le transport des folatesPaternal methyl donor deficiency : impact on cerebral development and folate transport.Directeur de thèse :Brigitte LEININGER-MULLERCo-directeur de thèse :Natacha DREUMONT
- ARNAUD EDMOND WIEDEMANNEtude comparative des aspects cliniques et physiopathologiques des erreurs innées du métabolisme de la vitamine B12 en fonction de l’âgeComparative study of the clinical and physiopathological aspects of inborn errors of vitamin B12 metabolism according to agingDirecteur de thèse :Jean-Louis GUEANTCo-directeur de thèse :Abderrahim OUSSALAH
- MARIE MULLERLymphome et Maladie Inflamatoire chronique de l'Intestin : une étude multicentrique française de grande ampleurLYMPHOMA IN PATIENTS WITH INFLAMMATORY BOWEL DISEASE: A FRENCH MULTICENTRIC RETROSPECTIVE NATION WIDE STUDY FROM GETAID.Directeur de thèse :Laurent PEYRIN-BIROULET
- KARIM MATMATInfluence de la méthionine synthase sur la neurogenèse postnatale &<br />
Conséquences ophtalmologiques de l’invalidation de la méthionine synthase.Influence of methionine synthase on postnatal neurogenesis &<br />
Ophthalmological consequences of invalidation of methionine synthase.Directeur de thèse :Rosa-Maria GUEANT-RODRIGUEZCo-directeur de thèse :Jean-Baptiste CONART - YOUSSEF SIBLINIépivariations du génome entier et du promoteur du gène mmachc induites par les facteurs de stress cellulaire et la transcription anti-sens aberrante dans les cellules normales, pluripotentes et cancéreusesgenome-wide and mmachc gene promoter epivariations induced by cellular stress factors and aberrant antisense transcription in normal, pluripotent, and cancer cellsDirecteur de thèse :Jean-Louis GUEANTCo-directeur de thèse :Abderrahim OUSSALAH
- ANNE-CHARLOTTE HEBALa restriction de l’apport alimentaire préventive dans la prise en charge des maladies inflammatoires chroniques de l’intestin dans un modèle murin.Preventive diet restriction in the management of chronic inflammatory bowel disease in a mouse model.Directeur de thèse :Laurent PEYRIN-BIROULETCo-directeur de thèse :Ndeye Coumba NDIAYE
- ADRIEN AUDRYModèle BMDC : l’apport de l’étude des mécanismes intracellulaires pour l’évaluation du pouvoir sensibilisant de substances industrielles.BMDC model : intracellular mechanisms study for the sensitizing powers evaluation of industrial chemicalsDirecteur de thèse :Brigitte LEININGER-MULLER
- ZIAD HASSANEtude des mécanismes physiopathologiques à l’origine des dysfonctionnements du système nerveux central associés aux maladies rares du métabolisme de la vitamine B12 et innovation thérapeutiqueStudy of the molecular mechanisms at the origin of the neurocognitive impairment associated with rare genetic diseases of the vitamin B12 metabolism and therapeutic innovationDirecteur de thèse :Grégory POURIECo-directeur de thèse :David COELHO
- MAËLLE QUEREGlioblastome et méthionine-dépendance : identification des mécanismes moléculaires pour définir des nouvelles cibles thérapeutiquesGlioblastoma and methionine-dependence: identification of molecular mechanisms as basis for new therapeutic targetsDirecteur de thèse :Bernard NAMOURCo-directeur de thèse :Shyue-Fang HSU-BATTAGLIA
- PAULINE MOSCAImpact d’une carence en vitamines B9 et B12 sur l’épitranscriptome m6A et la méthylation des protéines histonesAlterations of the m6A epitranscriptome and histones methylation following vitamins B9 and B12 deficiencyDirecteur de thèse :Bruno LEHEUPCo-directeur de thèse :Natacha DREUMONT
- Djésia ARNONEInfluence de la consommation alimentaire en sucre sur la sévérité de la colite chez l'animal via la modulation du microbiote intestinalInfluence of dietary sugar consumption on colitis severity in mice and modulation of gut microbiotaDirecteur de thèse :Laurent PEYRIN-BIROULETCo-directeur de thèse :Franck HANSMANNEL
- Darlene ANTOINEÉtude intégrative des facteurs environnementaux, de la génétique et de l’épigénétique du patient atteint d’obésité avant et après la chirurgie bariatriqueIntegrative study of environmental factors, genetics, and epigenetics of the patient with obesity before and after bariatric surgery<br />
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Directeur de thèse :Rosa-Maria GUEANT-RODRIGUEZ - Viola KOSGEIManifestations cardiaques des maladies héréditaires du métabolisme cellulaire de la vitamine B12 : étude sur deux modèles murins d’invalidation des gènes mtr et mmachcCardiac manifestations of inherited metabolic disease linked of cellular vitamin B12 uptake : study in two murine invalidation models of mtr and mmachc genes.<br />
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Directeur de thèse :Rosa-Maria GUEANT-RODRIGUEZ - CHARIF RASHKARôle des altérations génomiques et épigénomiques dans les mécanismes moléculaires à l’origine des pathologies associées aux maladies rares du métabolisme de la vitamine B12.Role of genomic and epigenomic alterations in the molecular mechanisms at the origin of the pathologies associated with rare inborn errors of vitamin B12 metabolism.Directeur de thèse :François FEILLETCo-directeur de thèse :David COELHO
- Lynda SABER CHERIFImpact d'une carence périnatale en donneurs de méthyles sur l’ontogenèse et la plasticité des réseaux hypothalamiques et l'homéostasie énergétiqueEffects of an early methyl donor deficiency on the ontogeny and plasticity of hypothalamic networks and energy homeostasisDirecteur de thèse :Jean-Luc DAVALCo-directeur de thèse :Carine BOSSENMEYER-POURIE
- Patrice GALLETCancérogenèse de l'adénocarcinome des fosses nasales: analyse génomique et transcriptionnelle de cellules de la fente olfactive prélevées par méthode non invasiveCarcinogenesis of nasal adenocarcinomas: genomic and transcriptional analysis of cells of the olfactory cleft collected by non-invasive methodDirecteur de thèse :Roger JANKOWSKICo-directeur de thèse :Jean-Louis GUEANT
- Zeinab HARBEffets de l’inflammation viscérale dans deux modèles de stéatohépatite non alcoolique (NASH) induite par la programmation foetale ou la carence en donneurs de méthyles.Effects of visceral inflammation in two models of non-alcoholic steatohepatitis (NASH)produced by fetal programming effect or by methyl donor deficiency.Directeur de thèse :Jean-Louis GUEANTCo-directeur de thèse :Jean-Pierre BRONOWICKI
Equipements
L’unité mixte de recherche Inserm U1256 - NGERE étudie l’impact des modifications épigénétiques engendrées par des déséquilibres nutritionnels et/ou des déficits congénitaux liés au métabolisme et au transport de la vitamine B12 chez l'homme.
Les protocoles expérimentaux mis en œuvre dans notre laboratoire font appel à des échantillons tels que du sérum, du plasma, des biopsies ou des cultures cellulaires d’origine humaine ou animale (modèles nutritionnels et/ou transgéniques).
Afin de mener à bien ses projets scientifiques et exploiter pleinement les échantillons dont elle dispose, l'UMR a mené depuis plusieurs années une politique d'acquisition d'équipements de haute technologie achetés en partie sur ses fonds propres ou via des campagnes d'équipements comme le CPER-BIOS ou l'appel à projet structurant du pôle BMS.
Services proposés
Plateforme de génomique fonctionnelle
La plateforme de Génomique Fonctionnelle créée en 2012 s’appuie sur les compétences de l’UMR1256 n-GERE en matière de séquençage NGS des patients atteints de maladies rares.
La plateforme met à disposition de la communauté scientifique, académique et industrielle des outils de haute technologie adaptée aux projets de :
- Génotypage haut débit sur puces BeadChip Infinium Illumina.
- Etude de la méthylation du génome humain sur puces Infinium Methylation EPIC-Illumina.
- Préparation et séquençage NGS de librairies d’ADN (séquenceur MiSeq-Illumina, prochainement NextSeq 550-Illumina).
- Analyse bioinformatique des données omiques.
Contact(s) :
David MEYREdavid.meyre [at] univ-lorraine.frAbderrahim OUSSALAHabderrahim.oussalah [at] univ-lorraine.frPhénotypage métabolique
Le laboratoire nGERE est équipé d'un spectromètre de masse (Shimadzu LCMS 8045, LC-MS/MS ESI triple quad) permettant l'analyse simultanée de nombreuses molécules impliquées dans diverses voies métaboliques telles que le métabolisme énergétique, le métabolisme des monocarbones, le métabolisme des acides organiques, etc. Afin d'élargir son spectre d'analyse, nous sommes également équipés d'un module complémentaire, le DPiMS, permettant des analyses métabolomiques à partir de biopsies brutes ou de coupes histologiques normalement incompatibles avec ce type d'instrument. Cet appareil nous permet d'analyser et quantifier en routine différents constituants afin d'établir un phénotypage métabolique sur nos modèles cellulaires ou animaux, ou encore d'étudier des cohortes de patients à partir de prélèvement de plasma.
Pour compléter ce phénotypage métabolique, nous disposons par ailleurs de divers instruments de haute technologie tels qu'un oxygraphe à haute résolution pour mesurer in vivo la respiration mitochondriale (Oroboros O2k), d'un lecteur de microplaques à balayage spectral pourvu d'injecteurs automatisés pour une détection en absorbance, luminescence et fluorescence (Molecular devices iD3) et d'une chaîne HPLC (Dionex, Ultimate 3000) nécessaires à l'établissement de profils métaboliques sur l'ensemble de nos modèles d'étude.
Contact(s) :
David MEYREdavid.meyre [at] univ-lorraine.frJean-Marc ALBERTOjean-marc.alberto [at] univ-lorraine.frEtude fonctionnelle sur l’axe intestin cerveau
L'utilisation d'animaux à des fins scientifiques reste indispensable pour la compréhension des mécanismes physiopathologiques et la recherche de nouvelles thérapies concernant les maladies dégénératives. Notre projet vise à comprendre les mécanismes moléculaires liant les troubles du métabolisme des monocarbones à des pathologies dégénératives du foie, du cœur et du cerveau, mais également les mécanismes impliquant le microbiote intestinal dans la survenue et l'évolution de maladies inflammatoires chroniques de l'intestin. Nos différents modèles expérimentaux utilisant des rongeurs permettent de mener des études à la fois comportementales, physiologiques et pharmacodynamiques.
Ainsi, outre une animalerie hébergeant nos animaux dans le respect des règles d'éthique en vigueur, notre laboratoire dispose à la fois des équipements et des compétences permettant l'exploration fonctionnelle de nos animaux, grâce à des instruments bien spécifiques tels que l'endoscope AIDA (Karl Storz) nécessaire à l'établissement d'un diagnostic par endoscopie colorectale, ou encore une caméra HR couplée à un logiciel ViewPoint (videotracking) dédié à l'acquisition de données générés lors de tests neurocomportementaux.
Contact(s) :
David MEYREdavid.meyre [at] univ-lorraine.frGrégory POURIEgregory.pourie [at] univ-lorraine.fr
Réseaux / Financement / Partenaires
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ANR France 2030, « IHU INFINY » « Institut hospitalo-universitaire (IHU) des maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI)» Porteur - Laurent PEYRIN-BIROULET, le CHRU de Nancy, la Métropole du Grand Nancy, l’Université de Lorraine et l’INSERM Est
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ANR, 2022-2025, « EPIGONE » « EpiGenOmics/genomic/metabolic interplay in pathomechanisms of iNborn Errors of methionine metabolism » Porteur - Jean-Louis GUÉANT
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ANR, 2024-2026, « PREDICTS » « Multi-omic PREdictors of Diagnosis, prognosis and monitoring of Inherited errors of Cobalamin meTaboliSm » Porteur - Rosa-Maria RODRIGUEZ GUÉANT
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Ligue contre le Cancer, 2024-2025, « 1CCHC » « Perturbations du métabolisme des monocarbones et méthylation des ARNm : rôle dans le développement de l'hépatocarcinome » Porteur - Natacha DREUMONT
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Ligue contre le Cancer, 2024-2025, « RICHTER » « Caractérisation du phosphoprotéomique du syndrome de Richter » Porteur - Julien BROSEUS
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- Contrat AVIESAN, 2021-2025, « FHU ARRIMAGE » « Assessment and integrative Research on Remodelng-Inflammation-MetAbolic Stress in systemic and hepatoGastrointestinal mEtabolic diseases », Porteur - Jean-Louis GUÉANT
- Contrat AVIESAN, 2021-2025, « FHU CURE » « CUring and pREventing chronic inflammatory condition », Porteur - Laurent PEYRIN-BIROULET
Vie de l'unité
- Secteur radioactivité
Une inspection des locaux NGERE par l’Autorité de Sureté Nucléaire a eu lieu le 05 mars 2020, en présence des personnes en vue d’obtenir le renouvellement d’agrément.
- Notifications de projets du MESRI faisant suite à un avis favorable de la part du Comité d’éthique en matière d’expérimentation animale
- Pr. Carine BOSSENMEYER-POURIE / Dr. Grégory POURIE : Influence d'une carence en donneurs de méthyles sur le développement de la maladie de Huntington : étude sur un modèle souris Htt-Q111.
- Pr. François FEILLET / Dr. Jean-Marc ALBERTO : Etude de tolérance et passage cérébral d’une nouvelle thérapeutique de la maladie de Menkes.
- Pr. Jean-Pierre BRONOWICKI : Impact de l’inhibition de TREM-1 sur la physiopathologie de l’hépatite aiguë alcoolique.
- Pr. Jean-Pierre BRONOWICKI / Dr. Racha ZGHEIB : Impact de l’inhibition de TREM-1 sur la physiopathologie de l’hépatite aiguë alcoolique.
- Pr. Brigitte LEININGER-MULLER / Dr. Natacha DREUMONT : Conséquences d’une carence paternelle en folates sur le développement cérébral du rat.
- Dr. Djésia ARNONE / Pr. Laurent PEYRIN-BIROULET : Impact de l’apport calorique alimentaire sur l’inflammation intestinale.
- Agrément OGM
- Autorisation délivrée pour le projet : « Etude des conséquences de l’homocystéinylation de la Huntingtine dans la physiopathologie de Huntington chez la souris hdhQ111 ».
- Autorisation délivrée pour le projet : « Impact de l’apport calorique alimentaire sur l’inflammation intestinale ».
- Acquisition des équipements
- Installation d’un séquenceur NextSeq 550 Illumina dans les locaux de la plateforme de génomique fonctionnelle, UMS2008/US40 IBSLor.
- Dans le cadre du CPER-BIOS 2015-2020 (piloté par l’Inserm), un spectromètre de masse LCMS-8045 (Shimadzu) ainsi qu’un générateur d’azote associé et un module DPiMS permettent de faire des analyses métabolomiques sur des fluides biologiques, des extraits cellulaires et tissulaires et des coupes histologiques
Publications
- Acute severe ulcerative colitis trials: the past, the present and the future- Gut - 10.1136/gutjnl-2024-332489Sailish Honap, Vipul Jairath, Bruce E Sands, Parambir S Dulai, Silvio Danese, Laurent Peyrin-Biroulet
- Navigating the complexities of drug development for inflammatory bowel disease- Nat Rev Drug Discov - 10.1038/s41573-024-00953-0Sailish Honap, Vipul Jairath, Silvio Danese, Laurent Peyrin-Biroulet
- Towards personalized genome-scale modeling of inborn errors of metabolism for systems medicine applications- Metabolism - 10.1016/j.metabol.2023.155738Almut Heinken, Sandra El Kouche, Rosa-Maria Guéant-Rodriguez, Jean-Louis Guéant
- - Nat Commun - 10.1038/s41467-022-34642-6Julien Broséus, Sébastien Hergalant, Julia Vogt, Eugen Tausch, Markus Kreuz, Anja Mottok, Christof Schneider, Caroline Dartigeas, Damien Roos-Weil, Anne Quinquenel, Charline Moulin, German Ott, Odile Blanchet, Cécile Tomowiak, Grégory Lazarian, Pierre Rouyer, Emil Chteinberg, Stephan H. Bernhart, Olivier Tournilhac, Guillaume Gauchotte, Sandra Lomazzi, Elise Chapiro, Florence Nguyen-Khac, Céline Chery, Frédéric Davi, Mathilde Hunault, Rémi Houlgatte, Andreas Rosenwald, Alain Delmer, David Meyre, Marie-Christine Béné, Catherine Thieblemont, Peter Lichter, Ole Ammerpohl, Jean-Louis Guéant, Romain Guièze, José Ignacio Martin-Subero, Florence Cymbalista, Pierre Feugier, Reiner Siebert, Stephan Stilgenbauer
- - Crit Rev Biochem Mol Biol - 10.1080/10409238.2021.1979459Jean-Louis Guéant, Rosa-Maria Guéant-Rodriguez, Viola J Kosgei, David Coelho
- A noncoding RNA modulator potentiates phenylalanine metabolism in mice- Science - 10.1126/science.aba4991Yajuan Li, Zhi Tan, Yaohua Zhang, Zhao Zhang, Qingsong Hu, Ke Liang, Yao Jun, Youqiong Ye, Yi-Chuan Li, Chunlai Li, Lan Liao, Jianming Xu, Zhen Xing, Yinghong Pan, Sujash S Chatterjee, Tina K Nguyen, Heidi Hsiao, Sergey D Egranov, Nagireddy Putluri, Cristian Coarfa, David H Hawke, Preethi H Gunaratne, Kuang-Lei Tsai, Leng Han, Mien-Chie Hung, George A Calin, Fares Namour, Jean-Louis Guéant, Ania C Muntau, Nenad Blau, V Reid Sutton, Manuel Schiff, François Feillet, Shuxing Zhang, Chunru Lin, Liuqing Yang
- - Metabolism - 10.1016/j.metabol.2019.153992Rose Ghemrawi, Carole Arnold, Shyue-Fang Battaglia-Hsu, Grégory Pourié, Isabelle Trinh, Christine Bassila, Charif Rashka, Arnaud Wiedemann, Justine Flayac, Aurélie Robert, Natacha Dreumont, François Feillet, Jean-Louis Guéant, David Coelho
- Benefits and limitations of genome-wide association studies- Nat Rev Genet - 10.1038/s41576-019-0127-1Vivian Tam, Nikunj Patel, Michelle Turcotte, Yohan Bossé, Guillaume Paré, David Meyre
- - J Pathol - 10.1002/path.5254Carine Bossenmeyer-Pourié, A David Smith, Sylvain Lehmann, Vincent Deramecourt, Bernard Sablonnière, Jean-Michel Camadro, Grégory Pourié, Racha Kerek, Deborah Helle, Remy Umoret, Rosa-Maria Guéant-Rodriguez, Valérie Rigau, Audrey Gabelle, Jeffrey M Sequeira, Edward V Quadros, Jean-Luc Daval, Jean-Louis Guéant
- - Nat Commun - 10.1038/s41467-017-02306-5Jean-Louis Guéant, Céline Chéry, Abderrahim Oussalah, Javad Nadaf, David Coelho, Thomas Josse, Justine Flayac, Aurélie Robert, Isabelle Koscinski, Isabelle Gastin, Pierre Filhine-Tresarrieu, Mihaela Pupavac, Alison Brebner, David Watkins, Tomi Pastinen, Alexandre Montpetit, Fadi Hariri, David Tregouët, Benjamin A Raby, Wendy K Chung, Pierre-Emmanuel Morange, D Sean Froese, Matthias R Baumgartner, Jean-François Benoist, Can Ficicioglu, Virginie Marchand, Yuri Motorin, Chrystèle Bonnemains, François Feillet, Jacek Majewski, David S Rosenblatt